Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b4Q3V0X2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms