Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms