Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf48Q3US17 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Znf48Q3US17 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Znf48Q3US17 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Znf48Q3US17 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Znf48Q3US17 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Znf48Q3US17 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Znf48Q3US17 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Znf48Q3US17 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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