Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx21Q3UR97 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snx21Q3UR97 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx21Q3UR97 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx21Q3UR97 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx21Q3UR97 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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