Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp30Q3UN04 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp30Q3UN04 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp30Q3UN04 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms