Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdgfl2Q3UMU9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms