Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms