Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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