Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mier3Q3UHF3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms