Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frmd8Q3UFK8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Frmd8Q3UFK8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms