Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cops9Q3U898 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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