Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms