Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TchpQ3TVW5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TchpQ3TVW5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TchpQ3TVW5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TchpQ3TVW5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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