Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc136Q3TVA9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms