Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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