Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms