Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cwc27Q3TKY6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms