Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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