Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cers3Q1A3B0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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