Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms