Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpusd2Q149F1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms