Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Traf3ip1Q149C2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Traf3ip1Q149C2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Traf3ip1Q149C2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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