Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms