Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col19a1Q0VF58 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms