Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc3h18Q0P678 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms