Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnn2Q08093 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnn2Q08093 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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