Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Cnn1Q08091 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cnn1Q08091 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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