Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms