Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Siah2Q06986 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms