Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cab39Q06138 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cab39Q06138 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Cab39Q06138 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cab39Q06138 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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