Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms