Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pfdn6Q03958 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn6Q03958 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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