Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnd1Q03719 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms