Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scg2Q03517 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scg2Q03517 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms