Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff2Q03404 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms