Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms