Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gjb5Q02739 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gjb5Q02739 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms