Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JupQ02257 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JupQ02257 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
JupQ02257 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JupQ02257 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JupQ02257 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
JupQ02257 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms