Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms