Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja5Q01231 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja5Q01231 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms