Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1cQ00896 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms