Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
F8a1Q00558 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms