Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms