Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms