Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps3aP97351 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms