Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mesp1P97309 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms