Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx1P83917 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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