Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gbx1P82976 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gbx1P82976 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gbx1P82976 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gbx1P82976 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gbx1P82976 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gbx1P82976 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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