Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabpb2P81069 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms