Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irx1P81068 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms